{"id":118643,"date":"2020-03-24T11:50:01","date_gmt":"2020-03-24T10:50:01","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/?p=118643"},"modified":"2020-03-24T14:09:48","modified_gmt":"2020-03-24T13:09:48","slug":"questions-multiples-sur-lhydroxychloroquine-debut-de-partie-plutot-que-fin-par-timiota","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/2020\/03\/24\/questions-multiples-sur-lhydroxychloroquine-debut-de-partie-plutot-que-fin-par-timiota\/","title":{"rendered":"<b>Questions multiples sur l&rsquo;hydroxychloroquine : d\u00e9but de partie plut\u00f4t que fin<\/b>, par Timiota"},"content":{"rendered":"<blockquote><p>Ouvert aux commentaires.<\/p><\/blockquote>\n<p>Il s&rsquo;agit donc de ce m\u00e9dicament anti-malaria (Plaqu\u00e9nil en commercial), test\u00e9 par le Pr Raoult \u00e0 grand bruit.<\/p>\n<p>C&rsquo;est pour l&rsquo;instant la situation d&rsquo;un ch\u00e2teau de cartes, que les acteurs cherchent \u00e0 consolider :<\/p>\n<p>1) Il y a les donn\u00e9es du Pr Raoult qui ont \u00e9t\u00e9 rendues publique le 16 mars par vid\u00e9o et <a href=\"https:\/\/www.medrxiv.org\/content\/10.1101\/2020.03.16.20037135v1.full.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">dispo ici<\/a> (article non encore accept\u00e9 que je sache).<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>Ces donn\u00e9es ont pu avoir l&rsquo;air l\u00e9g\u00e8res, statistiquement, car il les pr\u00e9sente en termes de % sur de faibles cohortes<br \/>\n(6 cas sur le plus faible sous-\u00e9chantillon, le risque de \u00ab\u00a0cherry-picking\u00a0\u00bb n&rsquo;est plus tr\u00e8s loin).<\/p>\n<p>A regarder de pr\u00e8s au niveau de la table 1 du <em>Supplementary material<\/em> o\u00f9 il y a les \u00e2ges, et les suivis journaliers (pas tous identiques, mais soit), on ne peut \u00e9carter cette \u00e9tude d&rsquo;un revers de la main, au contraire.<\/p>\n<p>C&rsquo;est donc tr\u00e8s grossier compar\u00e9 aux \u00e9tudes de grande cohorte, mais la probabilit\u00e9 de \u00ab\u00a0faux bons r\u00e9sultats\u00a0\u00bb est sinon infime du moins franchement faible (rien \u00e0 voir avec le cas de S\u00e9ralini, test du ma\u00efs OGM sur les rats d&rsquo;une lign\u00e9e d\u00e9j\u00e0 canc\u00e9reuse et pub dans le nouvel Obs, voir les dossiers de S. Huet \u00ab\u00a0Sciences2\u00a0\u00bb sur ce genre de sujet).<\/p>\n<p>Pour les curieux :<\/p>\n<p>Les chiffres dans le tableau des PCR de cette table, quand il y en a, me semblent \u00eatre (sous r\u00e9serve) les r\u00e9sultats du nombre de cycle des qRT-PCR (quantitative Real Time PCR) :<\/p>\n<p>C&rsquo;est le nombre de cycles d&rsquo;amplification (1 cycle = \u00ab\u00a0x 2\u00a0\u00bb dans la PCR th\u00e9orique) pour passer le seuil de d\u00e9tection, qui est une constante de la machine, et peu ou prou calibr\u00e9 (via la fluorescence d&rsquo;un intercalant de l&rsquo;ADN double brin).<\/p>\n<p>Il faut typiquement 30-35 cycles pour amplifier 1 seul ARN au seuil (2^30~10^9), des r\u00e9sultats type 29-34 indiquent des charges virales faibles, des r\u00e9sultats type 21-25 des charges fortes.<\/p>\n<p>Avec cette lecture, le tableau fait \u00e0 peu pr\u00e8s sens et ressemble quand m\u00eame \u00e0 une bonne nouvelle.<\/p>\n<p>Curieux que les auteurs n&rsquo;aient pas comment\u00e9 davantage le tableau dans son ensemble, sans doute question de pratiques m\u00e9dicales, il faut \u00ab\u00a0faire cohorte\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p>Quelqu&rsquo;un comme le Pr Bleibtreu \u00e0 la Piti\u00e9-Salp\u00eatri\u00e8re commence \u00e0 tourner casaque en faveur de la chloroquine au moins en test (lib\u00e9 17 mars <em>checknews<\/em>).<\/p>\n<p>Il faudrait voir les r\u00e9actions ailleurs en Europe (Espagne, Allemagne, Italie, Suisse, Su\u00e8de avec le Karolinska notamment), avis aux curieux polyglottes.<\/p>\n<p>Et suivre \u00e0 \u00e9chelle plus longue quelques pays \u00e0 syst\u00e8me sanitaire les plus fiables dans leur r\u00e9gion comme le Costa Rica et le B\u00e9nin (la chloroquine y est connue et sera utilis\u00e9e \u00ab\u00a0quoi qu&rsquo;il n&rsquo;en co\u00fbte pas\u00a0\u00bb).<\/p>\n<p>2) Les <a href=\"https:\/\/www.epicentro.iss.it\/coronavirus\/bollettino\/Report-COVID-2019_17_marzo-v2.pdf\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">donn\u00e9es de mortalit\u00e9 italiennes<\/a> (si elles sont bien repr\u00e9sentatives : \u00e9tiologie sur 355\/2003 <em>deceduti<\/em> (17,7% du total) elles identifient \u00e0 99% (disons &gt; 97% statistiquement) les d\u00e9c\u00e8s \u00e0 des malades COVID19 co-porteurs de pathologies (cardiaques, diab\u00e8te, respiratoire &#8230;), une ou plusieurs.<\/p>\n<p>M\u00eame chez les tr\u00e8s peu de jeunes de l&rsquo;\u00e9chantillon, les d\u00e9c\u00e8s semblent \u00eatre des cas d&rsquo;ob\u00e9sit\u00e9 ou de pathologies pr\u00e9-existantes assez lourdes.<\/p>\n<p>D&rsquo;o\u00f9 ce qui se profile, ce qui fera ou non tenir le ch\u00e2teau de cartes :<\/p>\n<p>3) La difficult\u00e9 est de choisir de donner ou pas de la chloroquine \u00e0 des patients dont la pr\u00e9-pathologie les met dans le spectre des contre-indications, ou dans un recouvrement assez fort de leur pathologies avec ce spectre. Notamment sur le plan cardiaque, m\u00eame si ce n&rsquo;est pas \u00ab\u00a0commun\u00a0\u00bb (heureusement). Mais le seul fait d&rsquo;avoir plus de 65 ans est un facteur \u00e0 signaler.<\/p>\n<p>Il n&rsquo;est pas impossible, si les contre-indications sont jaug\u00e9es correctement, que la chloroquine soit avantageuse pour les mono-pathologies et dans des tranches d&rsquo;\u00e2ge donn\u00e9es, mais le risque est que \u00e7a puisse \u00eatre long \u00e0 savoir.<\/p>\n<p>Si on applique le \u00ab\u00a0primum non nocere\u00a0\u00bb \u00e0 ce niveau, \u00e7a reste assez d\u00e9licat, le gain pourrait n&rsquo;\u00eatre \u00ab\u00a0que\u00a0\u00bb un facteur 3 (puisqu&rsquo;il est trop risqu\u00e9 de le donner \u00e0 tous les d\u00e9j\u00e0-malades), donc \u00ab\u00a0fin de la partie\u00a0\u00bb n&rsquo;est pas vraiment le mot : au lieu d&rsquo;avoir un facteur x30 de d\u00e9passement sur la capacit\u00e9 hospitali\u00e8re (\u00ab\u00a0immunit\u00e9 de horde\u00a0\u00bb non liss\u00e9e suivant les mod\u00e8les UK) ou un facteur x8 (\u00ab\u00a0immunit\u00e9 de horde\u00a0\u00bb mais liss\u00e9e par des mesures \u00ab\u00a0moyennes\u00a0\u00bb, m\u00eames sources, les seules \u00e0 avoir dit assez fort officiellement \u00e0 quoi les chiffres de l&rsquo;immunit\u00e9 de horde correspondraient) on aurait \u00ab\u00a0juste\u00a0\u00bb des facteurs x10 ou x2.5, ce qui veut dire, laisser 9\/10 ou 7\/10 des malades en rade. Pas d&rsquo;acceptabilit\u00e9 claire \u00e0 ce niveau.<\/p>\n<p>Je ne pense pas que Raoult soit vraiment dupe \u00e0 ce stade : il n&rsquo;y a pas de donn\u00e9es de co-pathologies pr\u00e9cises ni impr\u00e9cises m\u00eame dans son article, et il a int\u00e9r\u00eat \u00e0 maximiser son impact tant que cette affaire n&rsquo;est pas tir\u00e9e au clair. On en serait, pour prendre une image connue, \u00e0 la guerre de mouvement (et il bouge, l&rsquo;animal), mais il faut penser \u00e0 la guerre des tranch\u00e9es.<\/p>\n<p>Enfin une projection pessimiste (j&rsquo;aimerais avoir tort) :<\/p>\n<p>4) Aux USA avec des taux d&rsquo;ob\u00e9sit\u00e9 \u00e9lev\u00e9s (chez les Afro-am\u00e9ricains et les \u00ab\u00a0Natives\u00a0\u00bb notamment, chez les pauvres en g\u00e9n\u00e9ral), et le diab\u00e8te aussi assez fort (merci la malbouffe, on soup\u00e7onne depuis une d\u00e9cennie que c&rsquo;est le microbiome de l&rsquo;enfant qui ne converge jamais vers un \u00ab\u00a0bon microbiome\u00a0\u00bb dans l&rsquo;intestin pour cause d&rsquo;exc\u00e8s de sucres rapides, causant les d\u00e9s\u00e9quilibres d&rsquo;alimentation en cascade toute la vie), \u00e7a peut \u00eatre assez lourd, tout \u00e7a, avec une situation \u00e0 l&rsquo;italienne mais dans la tranche d&rsquo;\u00e2ge 10 ou 15 ans en-dessous, pour les pathologies chroniques de l&rsquo;<em>homo.e americans.e<\/em>. Donc malgr\u00e9 une pyramide \u00ab\u00a0jeune\u00a0\u00bb aux USA (natalit\u00e9 bien plus forte qu&rsquo;en Italie, mortalit\u00e9 plus jeune en moyenne), un impact qui serait similaire (\u00e0 la m\u00eame densit\u00e9 de contagieux, ils auraient 25.000 morts contre 4.500 pour l&rsquo;Italie maintenant, une asymptote \u00e0 100.000 aux USA contre 20.000 en Italie dans une vision pas trop pessimiste, les comt\u00e9s ruraux ont peu d&rsquo;hostos, et la prise en charge des pauvres ne sera pas bien mieux qu&rsquo;\u00e0 New Orleans\/Katrina \/ 9th ward).<\/p>\n<p>A l&rsquo;inverse, dans un sc\u00e9nario tr\u00e8s optimiste d&rsquo;un pays pouvant raisonner en isolation (pas trop la France, peut-\u00eatre la Su\u00e8de ou Taiwan), le passage en \u00ab\u00a0immunit\u00e9 de horde\u00a0\u00bb dans des conditions de connaissances th\u00e9rapeutiques fines (mais comment converger vite sur cette question des contre-indications graves ?), avec remise en marche des \u00e9coles d&rsquo;ici 6 semaines et test syst\u00e9matique de grands \u00e9chantillons pour que les moins de 50 ans red\u00e9marrent pendant que les plus de 50 ans attendent encore 2 ou 3 semaines \u00ab\u00a0planqu\u00e9s\u00a0\u00bb (pour ne pas exc\u00e9der la charge max des hostos), il y aurait (conditionnel de mise, au carr\u00e9) des esquisses favorables \u00e0 une fin de partie un peu moins lointaine que ce qu&rsquo;on entrevoit maintenant (12 semaines sur la base chinoise, avec les r\u00e9sidus de mouvement incontr\u00f4lables, le R0 qui ne descend pas \u00e0 0,2 mais 0,4 etc.) et donc un sc\u00e9nario qui resterait sous une forme de contr\u00f4le \u00e0 la limite de l&rsquo;acceptable, impliquant dans la foul\u00e9e qu&rsquo;une vision claire des solidarit\u00e9s soit proclam\u00e9e et maintenue.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<blockquote>\n<p>Ouvert aux commentaires.<\/p>\n<\/blockquote>\n<p>Il s&rsquo;agit donc de ce m\u00e9dicament anti-malaria (Plaqu\u00e9nil en commercial), test\u00e9 par le Pr Raoult \u00e0 grand bruit.<\/p>\n<p>C&rsquo;est pour l&rsquo;instant la situation d&rsquo;un ch\u00e2teau de cartes, que les acteurs cherchent \u00e0 consolider :<\/p>\n<p>1) Il y a les donn\u00e9es du Pr Raoult qui ont \u00e9t\u00e9 rendues publique le 16 mars par [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[6301],"tags":[7113,7019,7072,7114,7089],"class_list":["post-118643","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-epidemiologie","tag-chloroquine","tag-coronavirus","tag-covid-19","tag-didier-raoult","tag-immunite-de-groupe"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/118643","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=118643"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/118643\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":118666,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/118643\/revisions\/118666"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=118643"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=118643"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=118643"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}