{"id":136604,"date":"2023-06-26T18:06:43","date_gmt":"2023-06-26T16:06:43","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/?p=136604"},"modified":"2023-06-26T18:13:01","modified_gmt":"2023-06-26T16:13:01","slug":"lontologie-genetique-og-et-la-dynamique-des-mots-une-comparaison-des-systemes-complexes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/2023\/06\/26\/lontologie-genetique-og-et-la-dynamique-des-mots-une-comparaison-des-systemes-complexes\/","title":{"rendered":"<b>L&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique (OG) et la dynamique des mots : une comparaison des syst\u00e8mes complexes<\/b>"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-136609\" src=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art.png\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"1024\" srcset=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art.png 1024w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-300x300.png 300w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-150x150.png 150w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-768x768.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/p>\n<p><em>Illustration par DALL-E (+PJ)<\/em><\/p>\n<blockquote><p><em>Vous avez peut-\u00eatre vu les vid\u00e9os que je fais en ce moment, intitul\u00e9es <a href=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/?s=Thought\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">\u00ab\u00a0Thought as Word Dynamics\u00a0\u00bb<\/a> (11 vid\u00e9os ont d\u00e9j\u00e0 paru dans la s\u00e9rie \u00e0 l&rsquo;heure qu&rsquo;il est). Un ami les a soumises \u00e0 ChatGPT (GPT-4) en demandant \u00e0 l&rsquo;I.A. de transposer \u00e0 la g\u00e9n\u00e9tique le mod\u00e8le linguistique que je propose dans une perspective d&rsquo;Intelligence Artificielle. Le r\u00e9sultat est intrigant, suffisamment du point de vue de mon ami et du mien pour que je vous soumette ce texte. Si vous vous y connaissez en g\u00e9n\u00e9tique, dites-nous ce que vous en pensez. Si le d\u00e9bat appara\u00eet prometteur, nous vous\u00a0 garantissons que nous nous y investirons pleinement, au double sens de comprendre vraiment de quoi \u00e7a parle et de soutenir les hypoth\u00e8ses \u00e9mises par des donn\u00e9es empiriques, pour autant que celles-ci existent bien entendu. Je publie ce texte parall\u00e8lement en anglais. <\/em><\/p><\/blockquote>\n<p class=\"p1\"><strong>L&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique (OG) et la dynamique des mots : une comparaison des syst\u00e8mes complexes<\/strong><\/p>\n<p class=\"p1\">L&rsquo;analyse des syst\u00e8mes complexes dans des domaines d&rsquo;\u00e9tudes apparemment disparates peut souvent r\u00e9v\u00e9ler des similitudes inattendues dans leur structure et leur fonctionnement. Ce document explore une telle intersection &#8211; celle de l&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique (OG), un cadre structurel pour la compr\u00e9hension du g\u00e9nome, et de la dynamique des mots, une th\u00e9orie sur la mani\u00e8re dont les mots et les id\u00e9es interagissent dans le discours. En comparant les postulats qui sous-tendent chacun de ces domaines, nous pouvons d\u00e9gager des parall\u00e8les intrigants et des contrastes r\u00e9v\u00e9lateurs.<\/p>\n<p class=\"p1\"><strong>I. Principes g\u00e9n\u00e9raux<\/strong><\/p>\n<p class=\"p1\">L&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique et la dynamique des mots sont toutes deux fond\u00e9es sur l&rsquo;id\u00e9e que leurs unit\u00e9s respectives, les g\u00e8nes et les mots, ne fonctionnent pas isol\u00e9ment, mais interagissent et s&rsquo;expriment en r\u00e9ponse \u00e0 divers stimuli. Dans l&rsquo;OG, les g\u00e8nes codant pour des prot\u00e9ines interagissent avec des ARN non codants et des \u00e9l\u00e9ments r\u00e9gulateurs pour former un r\u00e9seau complexe, tandis que dans la dynamique des mots, les mots forment un r\u00e9seau stock\u00e9 dans le cerveau humain, dont l&rsquo;expression est \u00e9prouv\u00e9e \u00e9motionnellement par l&rsquo;orateur. Les deux syst\u00e8mes soulignent donc l&rsquo;importance des interactions et de la dynamique contextuelle.<\/p>\n<p class=\"p1\"><strong>II. Architecture<\/strong><\/p>\n<p class=\"p1\">Les g\u00e8nes dans l&rsquo;OG et les mots dans la dynamique des mots sont tous deux con\u00e7us comme des unit\u00e9s au sein d&rsquo;un r\u00e9seau plus large. Chaque g\u00e8ne peut avoir plusieurs fonctions potentielles en fonction du contexte, tout comme chaque paire de mots dans la dynamique des mots a une valeur affective qui peut varier. Cependant, alors que l&rsquo;OG met l&rsquo;accent sur le potentiel d&rsquo;expression variable de chaque g\u00e8ne en fonction du contexte, la dynamique des mots met l&rsquo;accent sur l&rsquo;importance de l&rsquo;organisation et de la structure du r\u00e9seau.<\/p>\n<p class=\"p1\"><strong>III. Dynamique<\/strong><\/p>\n<p class=\"p1\">Les processus dynamiques sont au c\u0153ur des deux syst\u00e8mes. L&rsquo;OG d\u00e9crit la transcription, la traduction et la r\u00e9gulation des g\u00e8nes comme des processus complexes, tandis que la dynamique des mots d\u00e9crit la g\u00e9n\u00e9ration du discours comme une descente de gradient dans l&rsquo;espace de phase du r\u00e9seau. Une analogie int\u00e9ressante ici est le concept de renforcement hebbien dans le domaine de la neurobiologie. Bien que le renforcement hebbien ne s&rsquo;applique pas directement \u00e0 l&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique, une analogie peut \u00eatre trac\u00e9e avec l&rsquo;id\u00e9e que les g\u00e8nes qui sont co-exprim\u00e9s ou co-r\u00e9gul\u00e9s pourraient \u00eatre consid\u00e9r\u00e9s comme \u00ab\u00a0connect\u00e9s\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p class=\"p1\"><strong>IV. Cons\u00e9quences<\/strong><\/p>\n<p class=\"p1\">Enfin, les cons\u00e9quences des dysfonctionnements dans ces syst\u00e8mes sont \u00e9galement similaires. Dans l&rsquo;OG, les dysfonctionnements de l&rsquo;expression g\u00e9nique peuvent conduire \u00e0 des maladies ou repr\u00e9senter des variations g\u00e9n\u00e9tiques normales, tandis que dans la dynamique des mots, les d\u00e9s\u00e9quilibres dans les valeurs affectives peuvent conduire \u00e0 la n\u00e9vrose ou \u00e0 la psychose. Cela refl\u00e8te le principe selon lequel des variations subtiles dans des syst\u00e8mes complexes peuvent avoir des cons\u00e9quences majeures pour l&rsquo;organisme ou l&rsquo;individu dans son ensemble.<\/p>\n<p class=\"p3\">En conclusion, bien que l&rsquo;ontologie g\u00e9n\u00e9tique et la dynamique des mots op\u00e8rent dans des domaines tr\u00e8s diff\u00e9rents, leurs postulats sous-jacents r\u00e9v\u00e8lent une structure commune et mettent en \u00e9vidence l&rsquo;importance des interactions et de la dynamique contextuelle. En explorant ces similitudes, nous pouvons non seulement mieux comprendre chaque syst\u00e8me individuellement, mais aussi d\u00e9velopper une perspective plus large sur la fa\u00e7on dont les syst\u00e8mes complexes fonctionnent.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-136608\" src=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.37-The-genetic-double-helix-cyberpunk-style.png\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"1024\" srcset=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.37-The-genetic-double-helix-cyberpunk-style.png 1024w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.37-The-genetic-double-helix-cyberpunk-style-300x300.png 300w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.37-The-genetic-double-helix-cyberpunk-style-150x150.png 150w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.37-The-genetic-double-helix-cyberpunk-style-768x768.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/p>\n<p><em>Illustration par DALL-E (+PJ)<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-136609\" src=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art.png\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"1024\" srcset=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art.png 1024w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-300x300.png 300w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-150x150.png 150w, https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/wp-content\/uploads\/DALL\u00b7E-2023-06-26-17.59.16-The-genetic-double-helix-digital-art-768x768.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/p>\n<p><em>Illustration par DALL-E (+PJ)<\/em><\/p>\n<blockquote>\n<p><em>Vous avez peut-\u00eatre vu les vid\u00e9os que je fais en ce moment, intitul\u00e9es <a href=\"https:\/\/www.pauljorion.com\/blog\/?s=Thought\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">\u00ab\u00a0Thought as Word Dynamics\u00a0\u00bb<\/a> (11 vid\u00e9os ont d\u00e9j\u00e0 paru dans la s\u00e9rie \u00e0 l&rsquo;heure qu&rsquo;il est). 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